Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16223Q8CBM3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16223Q8CBM3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms