Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn5Q8CBA2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms