Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Atg4aQ8C9S8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Atg4aQ8C9S8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Atg4aQ8C9S8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Atg4aQ8C9S8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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