Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc186Q8C9S4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc186Q8C9S4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms