Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln3Q8C5U9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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