Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc113Q8C5T8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc113Q8C5T8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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