Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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