Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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