Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Iffo1Q8BXL9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Iffo1Q8BXL9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Iffo1Q8BXL9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Iffo1Q8BXL9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Iffo1Q8BXL9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Iffo1Q8BXL9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Iffo1Q8BXL9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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