Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms