Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp38Q8BW70 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp38Q8BW70 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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