Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms