Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak4Q8BTW9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak4Q8BTW9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms