Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms