Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms