Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms