Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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