Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms