Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Liat1Q810M6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms