Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Cldn34b3Q80ZS5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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