Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms