Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alkbh8Q80Y20 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alkbh8Q80Y20 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms