Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ2

Rnf168, E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf168Q80XJ2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf168Q80XJ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf168Q80XJ2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf168Q80XJ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf168Q80XJ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf168Q80XJ2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf168Q80XJ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf168Q80XJ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf168Q80XJ2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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