Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms