Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Uhrf2Q7TMI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Uhrf2Q7TMI3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Uhrf2Q7TMI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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