Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms