Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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