Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmed3Q78IS1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms