Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp34Q6ZQ93 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp34Q6ZQ93 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms