Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms