Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CenpeQ6RT24 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms