Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf1cQ6PDZ2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1cQ6PDZ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1cQ6PDZ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1cQ6PDZ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Taf1cQ6PDZ2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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