Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms