Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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