Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt40Q6IFX3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Krt40Q6IFX3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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