Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atg9bQ6EBV9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg9bQ6EBV9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg9bQ6EBV9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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