Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca2Q6DIC0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms