Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms