Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc18Q640L5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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