Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a5Q63ZW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms