Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms