Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrhQ62361 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrhQ62361 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms