Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn2Q61330 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn2Q61330 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms