Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms