Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms