Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf8Q60846 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf8Q60846 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms