Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms