Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myh1Q5SX40 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms