Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tns3Q5SSZ5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tns3Q5SSZ5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms