Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms